新生儿肛门和直肠畸形并发症
常见并发症：肠梗阻,
发生低位性肠梗阻(由不同原因引起的一组临床症候群，它的特点是肠内容物不能顺利通过肠道，从而引起一系列病理生理变化和临床症状。低位肠梗阻是指回肠末端和结直肠梗阻。)，水电解质平衡紊乱，严重影响患儿生命。
常合并瘘管形成，无肛未伴瘘管形成发生率仅占整个病例5%左右。据统计，新生儿男性除会阴瘘外以直肠尿道瘘为多见，而女性除会阴瘘外直肠舟状窝瘘为主。