维生素B1缺乏有周围神经炎表现者须与铅中毒，砷中毒及因白喉，菌痢，麻风等感染引起者相鉴别，有浮肿者须与肾炎，营养不良及生理性浮肿区分，尿常规检查，血浆蛋白测定以及检查有无伴随的周围神经炎症状对诊断有助，有心力衰竭表现者应同其他高输出量型心脏病伴心力衰竭，（如甲亢性心脏病，贫血性心脏病）及中毒性，病毒性心肌炎引起者鉴别。
在酗酒者，维生素B1缺乏症可与肝病，酒精中毒表现同时存在，有时不易区分，需仔细观察作出诊断。